MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Cyanothece sp. PCC 7425 plasmid pP742501

Total Repeats: 2770

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011880	ATAGT	2	10	69	78	40 %	40 %	20 %	0 %	219883097
2	NC_011880	AAGC	2	8	97	104	50 %	0 %	25 %	25 %	219883097
3	NC_011880	ATA	2	6	145	150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219883097
4	NC_011880	GAC	2	6	180	185	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883097
5	NC_011880	T	7	7	271	277	0 %	100 %	0 %	0 %	219883097
6	NC_011880	ATGC	2	8	323	330	25 %	25 %	25 %	25 %	219883097
7	NC_011880	CAG	2	6	345	350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883097
8	NC_011880	GCTG	2	8	431	438	0 %	25 %	50 %	25 %	219883097
9	NC_011880	A	6	6	449	454	100 %	0 %	0 %	0 %	219883097
10	NC_011880	TGA	2	6	658	663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219883097
11	NC_011880	GAG	2	6	672	677	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219883097
12	NC_011880	T	7	7	699	705	0 %	100 %	0 %	0 %	219883097
13	NC_011880	AGCTT	2	10	706	715	20 %	40 %	20 %	20 %	219883097
14	NC_011880	TC	3	6	726	731	0 %	50 %	0 %	50 %	219883097
15	NC_011880	CCT	2	6	818	823	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219883097
16	NC_011880	TCC	2	6	1011	1016	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219883097
17	NC_011880	AGGT	2	8	1030	1037	25 %	25 %	50 %	0 %	219883097
18	NC_011880	CCA	2	6	1067	1072	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219883097
19	NC_011880	TGA	2	6	1219	1224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219883097
20	NC_011880	TGC	2	6	1270	1275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883097
21	NC_011880	GC	3	6	1296	1301	0 %	0 %	50 %	50 %	219883097
22	NC_011880	CTG	2	6	1311	1316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883097
23	NC_011880	GCA	2	6	1376	1381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883097
24	NC_011880	GAC	2	6	1470	1475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883097
25	NC_011880	GAA	2	6	1575	1580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219883097
26	NC_011880	TAG	2	6	1612	1617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219883097
27	NC_011880	ATCCG	2	10	1705	1714	20 %	20 %	20 %	40 %	219883097
28	NC_011880	ATGC	2	8	1877	1884	25 %	25 %	25 %	25 %	219883097
29	NC_011880	TCA	2	6	1937	1942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219883097
30	NC_011880	CGC	2	6	1956	1961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219883097
31	NC_011880	AAAC	2	8	1993	2000	75 %	0 %	0 %	25 %	219883097
32	NC_011880	AGA	2	6	2025	2030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219883097
33	NC_011880	CAT	2	6	2072	2077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219883097
34	NC_011880	AAGAT	2	10	2083	2092	60 %	20 %	20 %	0 %	219883097
35	NC_011880	ATC	2	6	2214	2219	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219883097
36	NC_011880	AAT	2	6	2220	2225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219883097
37	NC_011880	T	7	7	2408	2414	0 %	100 %	0 %	0 %	219883098
38	NC_011880	A	6	6	2621	2626	100 %	0 %	0 %	0 %	219883098
39	NC_011880	T	6	6	2650	2655	0 %	100 %	0 %	0 %	219883098
40	NC_011880	ATC	2	6	2731	2736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219883098
41	NC_011880	A	6	6	2801	2806	100 %	0 %	0 %	0 %	219883098
42	NC_011880	TA	3	6	2869	2874	50 %	50 %	0 %	0 %	219883098
43	NC_011880	ATT	2	6	2879	2884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219883098
44	NC_011880	CAC	3	9	4182	4190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219883099
45	NC_011880	TCC	2	6	4258	4263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219883099
46	NC_011880	TTC	2	6	4284	4289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219883099
47	NC_011880	CCA	2	6	4436	4441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219883100
48	NC_011880	ATCTTC	2	12	4477	4488	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	219883100
49	NC_011880	ACC	2	6	4976	4981	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219883101
50	NC_011880	AAG	2	6	4983	4988	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219883101
51	NC_011880	CAGT	2	8	5055	5062	25 %	25 %	25 %	25 %	219883101
52	NC_011880	GGGA	2	8	5292	5299	25 %	0 %	75 %	0 %	219883102
53	NC_011880	CAC	3	9	5357	5365	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219883102
54	NC_011880	AGGAG	2	10	5419	5428	40 %	0 %	60 %	0 %	219883102
55	NC_011880	GCA	2	6	5441	5446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883102
56	NC_011880	TAC	2	6	5453	5458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219883102
57	NC_011880	TCG	2	6	5460	5465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883102
58	NC_011880	AGA	3	9	5524	5532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219883102
59	NC_011880	GTGG	2	8	6279	6286	0 %	25 %	75 %	0 %	219883103
60	NC_011880	GAT	2	6	6335	6340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219883103
61	NC_011880	TGC	2	6	6385	6390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883103
62	NC_011880	CGTTA	2	10	6407	6416	20 %	40 %	20 %	20 %	219883103
63	NC_011880	GAC	2	6	6480	6485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883103
64	NC_011880	ATG	2	6	6529	6534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219883103
65	NC_011880	GAG	3	9	6579	6587	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219883103
66	NC_011880	GC	3	6	6614	6619	0 %	0 %	50 %	50 %	219883103
67	NC_011880	GCG	2	6	6651	6656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219883103
68	NC_011880	CTGG	2	8	6704	6711	0 %	25 %	50 %	25 %	219883103
69	NC_011880	G	8	8	6759	6766	0 %	0 %	100 %	0 %	219883103
70	NC_011880	TGG	2	6	6802	6807	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219883103
71	NC_011880	CTT	2	6	6812	6817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219883103
72	NC_011880	G	6	6	6884	6889	0 %	0 %	100 %	0 %	219883103
73	NC_011880	CTG	2	6	6961	6966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883103
74	NC_011880	TGC	2	6	6977	6982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883103
75	NC_011880	GCT	2	6	6984	6989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883103
76	NC_011880	TCG	2	6	6997	7002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883103
77	NC_011880	AAC	2	6	7202	7207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219883103
78	NC_011880	G	6	6	7271	7276	0 %	0 %	100 %	0 %	219883103
79	NC_011880	TGG	2	6	7280	7285	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219883103
80	NC_011880	GGC	2	6	7370	7375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219883103
81	NC_011880	GCG	2	6	7380	7385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219883103
82	NC_011880	GGC	2	6	7398	7403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219883103
83	NC_011880	TGG	2	6	7445	7450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219883103
84	NC_011880	CTTGC	2	10	7471	7480	0 %	40 %	20 %	40 %	219883103
85	NC_011880	AGC	2	6	7531	7536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883103
86	NC_011880	AAG	2	6	7566	7571	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219883103
87	NC_011880	TCG	2	6	7575	7580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883103
88	NC_011880	AAG	2	6	8175	8180	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219883104
89	NC_011880	CTTTTA	2	12	8254	8265	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	219883104
90	NC_011880	AGG	2	6	8311	8316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	219883104
91	NC_011880	TAC	2	6	8353	8358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219883104
92	NC_011880	TTCTG	2	10	8513	8522	0 %	60 %	20 %	20 %	219883104
93	NC_011880	CCA	2	6	8563	8568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219883104
94	NC_011880	TGAT	2	8	8575	8582	25 %	50 %	25 %	0 %	219883104
95	NC_011880	TAT	2	6	8641	8646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219883104
96	NC_011880	T	6	6	8669	8674	0 %	100 %	0 %	0 %	219883104
97	NC_011880	TAT	2	6	8759	8764	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	219883104
98	NC_011880	AT	3	6	8880	8885	50 %	50 %	0 %	0 %	219883105
99	NC_011880	G	6	6	8967	8972	0 %	0 %	100 %	0 %	219883105
100	NC_011880	TTC	2	6	9011	9016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	219883105
101	NC_011880	TGA	2	6	9377	9382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219883106
102	NC_011880	GCG	2	6	9486	9491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219883106
103	NC_011880	GCC	2	6	9663	9668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219883107
104	NC_011880	CAA	2	6	9698	9703	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219883107
105	NC_011880	CCG	2	6	9754	9759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219883107
106	NC_011880	GCG	2	6	9805	9810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	219883107
107	NC_011880	G	6	6	9838	9843	0 %	0 %	100 %	0 %	219883107
108	NC_011880	GGT	2	6	9886	9891	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219883107
109	NC_011880	GCA	2	6	10051	10056	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883107
110	NC_011880	ACT	2	6	10107	10112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219883107
111	NC_011880	ATG	2	6	10156	10161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219883107
112	NC_011880	CAG	2	6	10162	10167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883108
113	NC_011880	GCC	3	9	10198	10206	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219883108
114	NC_011880	CCG	2	6	10220	10225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219883108
115	NC_011880	GGCA	2	8	10268	10275	25 %	0 %	50 %	25 %	219883108
116	NC_011880	GAT	2	6	10350	10355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219883108
117	NC_011880	GAC	2	6	10405	10410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883108
118	NC_011880	TTTG	2	8	10455	10462	0 %	75 %	25 %	0 %	219883108
119	NC_011880	CTGGA	2	10	10552	10561	20 %	20 %	40 %	20 %	219883108
120	NC_011880	GAA	2	6	10564	10569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219883108
121	NC_011880	TG	3	6	10573	10578	0 %	50 %	50 %	0 %	219883108
122	NC_011880	TCC	2	6	10584	10589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219883108
123	NC_011880	ATG	2	6	10631	10636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219883108
124	NC_011880	GCT	2	6	10666	10671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883108
125	NC_011880	TCA	2	6	10700	10705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219883108
126	NC_011880	TGG	2	6	10733	10738	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219883108
127	NC_011880	CTC	2	6	10756	10761	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219883108
128	NC_011880	AAG	2	6	10782	10787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219883108
129	NC_011880	ATG	2	6	10796	10801	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219883108
130	NC_011880	TGAT	2	8	11029	11036	25 %	50 %	25 %	0 %	219883109
131	NC_011880	CCG	2	6	11056	11061	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	219883109
132	NC_011880	GTT	2	6	11067	11072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219883109
133	NC_011880	TGG	2	6	11136	11141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219883109
134	NC_011880	CAC	2	6	11201	11206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219883109
135	NC_011880	ATA	2	6	11248	11253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219883109
136	NC_011880	TCC	2	6	11329	11334	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	219883109
137	NC_011880	AC	3	6	11370	11375	50 %	0 %	0 %	50 %	219883109
138	NC_011880	AGC	2	6	11389	11394	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883109
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140	NC_011880	CAA	2	6	11490	11495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	219883109
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148	NC_011880	GAGAG	2	10	12086	12095	40 %	0 %	60 %	0 %	219883110
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150	NC_011880	TCA	2	6	12119	12124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219883110
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157	NC_011880	G	6	6	12396	12401	0 %	0 %	100 %	0 %	219883111
158	NC_011880	CGGG	2	8	12402	12409	0 %	0 %	75 %	25 %	219883111
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164	NC_011880	TGG	2	6	12726	12731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	219883111
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169	NC_011880	CTG	2	6	13087	13092	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883111
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252	NC_011880	GCA	2	6	17439	17444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883113
253	NC_011880	AAT	2	6	17476	17481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219883113
254	NC_011880	TCTT	2	8	17517	17524	0 %	75 %	0 %	25 %	219883113
255	NC_011880	GTA	2	6	17574	17579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219883113
256	NC_011880	GCA	2	6	17655	17660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883113
257	NC_011880	TCACT	2	10	17662	17671	20 %	40 %	0 %	40 %	219883113
258	NC_011880	TGCTT	2	10	17703	17712	0 %	60 %	20 %	20 %	219883113
259	NC_011880	ACG	2	6	17744	17749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	219883113
260	NC_011880	CAT	2	6	17812	17817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219883113
261	NC_011880	GTT	2	6	17939	17944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219883113
262	NC_011880	AAAGA	2	10	17990	17999	80 %	0 %	20 %	0 %	219883113
263	NC_011880	TCAGG	2	10	18016	18025	20 %	20 %	40 %	20 %	219883113
264	NC_011880	AAT	2	6	18046	18051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219883113
265	NC_011880	AGT	2	6	18058	18063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219883113
266	NC_011880	AGT	2	6	18070	18075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	219883113
267	NC_011880	T	6	6	18075	18080	0 %	100 %	0 %	0 %	219883113
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270	NC_011880	GAA	2	6	18131	18136	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	219883113
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273	NC_011880	GCT	2	6	18228	18233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883113
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275	NC_011880	GCT	2	6	18277	18282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	219883113
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281	NC_011880	CCA	2	6	18567	18572	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	219883113
282	NC_011880	TAAG	2	8	18583	18590	50 %	25 %	25 %	0 %	219883113
283	NC_011880	CAT	2	6	18679	18684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	219883113
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286	NC_011880	ATA	2	6	18796	18801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	219883113
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292	NC_011880	AT	3	6	18920	18925	50 %	50 %	0 %	0 %	219883113
293	NC_011880	TGT	2	6	18951	18956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219883113
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295	NC_011880	TGCT	2	8	19043	19050	0 %	50 %	25 %	25 %	219883113
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301	NC_011880	GGCA	2	8	19408	19415	25 %	0 %	50 %	25 %	219883113
302	NC_011880	GTT	2	6	19471	19476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	219883113
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